MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015508	ATC	2	6	165633	165638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715536
3002	NC_015508	CAT	2	6	165690	165695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715536
3003	NC_015508	CGC	2	6	165696	165701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715536
3004	NC_015508	TCA	2	6	165728	165733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715536
3005	NC_015508	GCG	2	6	165791	165796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715536
3006	NC_015508	GGTT	2	8	165813	165820	0 %	50 %	50 %	0 %	332715536
3007	NC_015508	TTG	2	6	165892	165897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715536
3008	NC_015508	TGA	2	6	165944	165949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715536
3009	NC_015508	GGA	2	6	165951	165956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715536
3010	NC_015508	TCT	2	6	165986	165991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715536
3011	NC_015508	GCC	2	6	166009	166014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715536
3012	NC_015508	TGA	2	6	166109	166114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715536
3013	NC_015508	GT	3	6	166121	166126	0 %	50 %	50 %	0 %	332715536
3014	NC_015508	TTG	2	6	166195	166200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715536
3015	NC_015508	GCCG	2	8	166335	166342	0 %	0 %	50 %	50 %	332715536
3016	NC_015508	GCA	2	6	166493	166498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
3017	NC_015508	ATG	2	6	166573	166578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715536
3018	NC_015508	CCG	2	6	166579	166584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715536
3019	NC_015508	CCG	2	6	166666	166671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715536
3020	NC_015508	CGA	4	12	166682	166693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
3021	NC_015508	TTG	2	6	166771	166776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715536
3022	NC_015508	ACG	2	6	166777	166782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
3023	NC_015508	TTC	2	6	166791	166796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715536
3024	NC_015508	GCA	2	6	166856	166861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715536
3025	NC_015508	GAT	2	6	166869	166874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715536
3026	NC_015508	TTC	2	6	166876	166881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715536
3027	NC_015508	GGC	2	6	166971	166976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715537
3028	NC_015508	CCT	2	6	167021	167026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715537
3029	NC_015508	TCC	2	6	167038	167043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715537
3030	NC_015508	ATGACG	2	12	167062	167073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715537
3031	NC_015508	AG	3	6	167081	167086	50 %	0 %	50 %	0 %	332715537
3032	NC_015508	GCGCTG	2	12	167259	167270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332715537
3033	NC_015508	GCC	2	6	167271	167276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715537
3034	NC_015508	TGCC	2	8	167318	167325	0 %	25 %	25 %	50 %	332715537
3035	NC_015508	GAT	2	6	167403	167408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715537
3036	NC_015508	GAC	2	6	167457	167462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3037	NC_015508	GACCGG	2	12	167494	167505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332715537
3038	NC_015508	TCG	2	6	167650	167655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3039	NC_015508	CAA	2	6	167660	167665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715537
3040	NC_015508	CAT	2	6	167703	167708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715537
3041	NC_015508	CAG	2	6	167736	167741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3042	NC_015508	AAGC	2	8	167789	167796	50 %	0 %	25 %	25 %	332715537
3043	NC_015508	GTG	2	6	167842	167847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715537
3044	NC_015508	TGC	2	6	167869	167874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3045	NC_015508	GACGTA	2	12	167877	167888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715537
3046	NC_015508	TGA	2	6	167924	167929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715537
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3049	NC_015508	CAGTG	2	10	168003	168012	20 %	20 %	40 %	20 %	332715537
3050	NC_015508	TCG	2	6	168019	168024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3051	NC_015508	CCG	2	6	168085	168090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715537
3052	NC_015508	CCTCG	2	10	168165	168174	0 %	20 %	20 %	60 %	332715537
3053	NC_015508	CGA	2	6	168215	168220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3054	NC_015508	ATC	2	6	168274	168279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715537
3055	NC_015508	CGCC	2	8	168300	168307	0 %	0 %	25 %	75 %	332715537
3056	NC_015508	GGC	2	6	168311	168316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715537
3057	NC_015508	GTC	2	6	168333	168338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3058	NC_015508	ATG	2	6	168397	168402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715537
3059	NC_015508	GCGG	2	8	168405	168412	0 %	0 %	75 %	25 %	332715537
3060	NC_015508	GGAA	2	8	168473	168480	50 %	0 %	50 %	0 %	332715537
3061	NC_015508	CCGTG	2	10	168500	168509	0 %	20 %	40 %	40 %	332715537
3062	NC_015508	GAT	2	6	168546	168551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715537
3063	NC_015508	GCA	2	6	168610	168615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715537
3064	NC_015508	GCG	2	6	168788	168793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715538
3065	NC_015508	AAGG	2	8	168819	168826	50 %	0 %	50 %	0 %	332715538
3066	NC_015508	AGC	2	6	168832	168837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715538
3067	NC_015508	ACG	2	6	168838	168843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715538
3068	NC_015508	TCA	2	6	168881	168886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715538
3069	NC_015508	CGGT	2	8	168919	168926	0 %	25 %	50 %	25 %	332715538
3070	NC_015508	CGCGG	2	10	168942	168951	0 %	0 %	60 %	40 %	332715538
3071	NC_015508	CGCCAG	2	12	168966	168977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	332715538
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3073	NC_015508	GTC	2	6	169057	169062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715538
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3078	NC_015508	CGA	2	6	169433	169438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715538
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3081	NC_015508	GAA	2	6	169587	169592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715538
3082	NC_015508	CAC	2	6	169623	169628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715538
3083	NC_015508	CCA	2	6	169640	169645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715538
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3085	NC_015508	ATTC	2	8	169739	169746	25 %	50 %	0 %	25 %	332715538
3086	NC_015508	CCA	2	6	169763	169768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715538
3087	NC_015508	AGC	2	6	169814	169819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715539
3088	NC_015508	GAT	2	6	169828	169833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715539
3089	NC_015508	GAT	2	6	169840	169845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715539
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3091	NC_015508	CAT	2	6	169864	169869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715539
3092	NC_015508	CGA	2	6	169911	169916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715539
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3100	NC_015508	CGA	2	6	170199	170204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715539
3101	NC_015508	GCG	2	6	170238	170243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715539
3102	NC_015508	AAG	2	6	170246	170251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715539
3103	NC_015508	TGG	2	6	170382	170387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715539
3104	NC_015508	TTG	2	6	170495	170500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715539
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3107	NC_015508	GCC	2	6	170539	170544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715539
3108	NC_015508	ACG	2	6	170564	170569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715539
3109	NC_015508	GCCTGC	2	12	170603	170614	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332715539
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3111	NC_015508	TCA	2	6	170649	170654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715539
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3114	NC_015508	AGC	2	6	170729	170734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715539
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3119	NC_015508	GC	3	6	171045	171050	0 %	0 %	50 %	50 %	332715540
3120	NC_015508	TCA	2	6	171111	171116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715540
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3122	NC_015508	GAG	2	6	171143	171148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715540
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3126	NC_015508	TGA	2	6	171369	171374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715540
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3132	NC_015508	GCT	2	6	171891	171896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715540
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3153	NC_015508	CCG	2	6	172833	172838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715540
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3227	NC_015508	GC	3	6	176109	176114	0 %	0 %	50 %	50 %	332715543
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3231	NC_015508	GCGAT	2	10	176357	176366	20 %	20 %	40 %	20 %	332715544
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3241	NC_015508	CGA	2	6	176784	176789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3242	NC_015508	GCA	2	6	176815	176820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3243	NC_015508	CG	3	6	176853	176858	0 %	0 %	50 %	50 %	332715544
3244	NC_015508	C	6	6	176865	176870	0 %	0 %	0 %	100 %	332715544
3245	NC_015508	ATC	2	6	176909	176914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715544
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3248	NC_015508	CG	3	6	177042	177047	0 %	0 %	50 %	50 %	332715544
3249	NC_015508	TGG	2	6	177142	177147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715545
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3253	NC_015508	CAT	2	6	177260	177265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715545
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3278	NC_015508	TCG	2	6	178459	178464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715545
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3282	NC_015508	CAGC	2	8	178613	178620	25 %	0 %	25 %	50 %	332715545
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3362	NC_015508	GCG	2	6	182022	182027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715547
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3481	NC_015508	ATC	2	6	188067	188072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715553
3482	NC_015508	GAT	2	6	188162	188167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715553
3483	NC_015508	TCC	3	9	188172	188180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715553
3484	NC_015508	TCG	2	6	188274	188279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715553
3485	NC_015508	TGA	2	6	188298	188303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715553
3486	NC_015508	CTG	2	6	188339	188344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715553
3487	NC_015508	CCG	2	6	188411	188416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715553
3488	NC_015508	ACCGA	2	10	188577	188586	40 %	0 %	20 %	40 %	332715553
3489	NC_015508	ACC	2	6	188596	188601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715553
3490	NC_015508	CCG	2	6	188650	188655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715553
3491	NC_015508	CGT	2	6	188666	188671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715553
3492	NC_015508	GGTCC	2	10	188698	188707	0 %	20 %	40 %	40 %	332715553
3493	NC_015508	TAA	2	6	188739	188744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715553
3494	NC_015508	CGG	2	6	188794	188799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715553
3495	NC_015508	GC	3	6	188860	188865	0 %	0 %	50 %	50 %	332715553
3496	NC_015508	A	6	6	188963	188968	100 %	0 %	0 %	0 %	332715553
3497	NC_015508	ATCAGG	2	12	188991	189002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715553
3498	NC_015508	CAGC	2	8	189100	189107	25 %	0 %	25 %	50 %	332715554
3499	NC_015508	CGC	4	12	189142	189153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715554
3500	NC_015508	CCA	2	6	189167	189172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715554

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